Archiv novinek
Článek z Oddělení biofyzikální chemie a molekulární onkologie opět zamířil do časopisu pod hlavičkou Elsevieru.
28. 11. 2023
Co přinesl výzkum možnosti využití N-methyl mezoporfyrinu IX (NMM) jako sondy pro elektrochemickou detekci? Na to se snaží odpovědět skupina kolem Assoc. Prof. Miroslava Fojty, PhD. z Oddělení biofyzikální chemie a molekulární onkologie v odborném článku časopisu Bioelectrochemistry.
V této práci se zkoumali možnosti využití N-methyl mezoporfyrinu IX (NMM) jako sondy pro elektrochemickou detekci a studium G-kvadruplexů, stabilních sekundárních struktur DNA, které hrají roli v regulaci významných biologických procesů. Výsledky této práce ukázaly, že pomocí této nově vyvinuté metody lze G-kvadruplexy detekovat a odlišit je od jiných struktur DNA na základě jejich rozdílné adsorpce na povrchu pracovní elektrody. Tento způsob dal také výzkumníkům schopnost sledovat postupnou tvorbu G-kvadruplexové struktury s účinností srovnatelnou s konvenční metodou CD spektroskopie, ale při menší spotřebě experimentálního materiálu.
Celý článek naleznete v odkaze ZDE
Vědecká skupina kolem prof. Šponera publikuje článek v Journal of Chemical Theory and Compution.
23. 11. 2023
Vědecká skupina prof. Šponera z oddělení Struktury a dynamiky nukleonových kyselin, má nový článek v žurnálu Americké Chemické Společnosti (ACS) - Journal of Chemical Theory and Compution.
Profesor Jiří Šponer z Biofyzikálního ústavu se se svým týmem intenzivně věnuje vývoji empirických potenciálů (silových polí) pro molekulové dynamické simulace nukleových kyselin. 
V aktuální práci identifikovali artefakt v silovém potenciálu, kdy se atomy popisující interakci báze-fosfát dostávají do sterického konfliktu. Daný defekt v silových potenciálech zůstával skryt vývojářům silových polí po celou poslední dekádu. Vědci navrhli a otestovali jednoduchou opravu, která výrazně zlepšuje chování těchto potenciálů pro studium struktury a dynamiky nukleových kyselin.
CELÝ ČLÁNEK PRO PŘEČTENÍ V ODKAZE ZDE
Signální dráha adenylyl cyklázy je považována za klíčový regulátor funkcí imunitního systému - nový článek z oddělení BIOFYZIKY IMUNITNÍHO SYSTÉMU
17. 11. 2023
Nový výzkum zaměřený na imunitní systém naznačuje, že signalizační dráha adenylyl cyklázy (AC) může hrát klíčovou roli v regulaci funkcí imunitního systému. Studie se soustředila na účinky cyklického adenozinmonofosfátu (cAMP) na diferenciaci a funkce T pomocných (Th) buněk, konkrétně na vývoj Th1, Th2 a Th17 podskupin.
Nový výzkum zaměřený na imunitní systém naznačuje, že adenylyl cykláza (AC) signalizační dráha může hrát klíčovou roli v regulaci funkcí imunitního systému. Studie se soustředila na účinky cyklického adenozinmonofosfátu (cAMP) na diferenciaci a funkce T pomocných (Th) buněk, konkrétně na vývoj Th1, Th2 a Th17 podskupin.
Výzkumníci použili forskolin (FSK), známý aktivátor AC, a zjistili, že FSK zvyšuje specifické markery pro Th1 a podporuje diferenciaci Th2, i když s negativními dopady na metabolismus buněk. Naopak, Th17 imunofenotyp byl silně potlačen s vysoce specifickým zvýšením hladiny CXCL13. Studie také potvrdila příčinnou souvislost mezi FSK-aktivovanou produkcí cAMP a pozorovanými účinky na diferenciaci Th2 pomocí inhibitoru AC. Celkově naznačuje, že zvýšení cAMP pomocí FSK může ovlivnit diferenciaci Th1, Th2 a Th17, což může přispět k identifikaci nových terapeutických cílů pro léčbu patologických procesů spojených s Th buňkami.
CELÝ ČLÁNEK KE STAŽENÍ ZDE
Martin Falk jedním ze spoluautorů nové knihy RADIOBIOLOGY TEXTBOOK
2. 10. 2023
S radostí a hrdostí oznamujeme, že se Assoc. Prof. RNDr. Martin Falk, Ph.D. z Biofyzikálního ústavu AV ČR spoluautorsky podílel na dokončení a vydání nové učebnice s názvem RADIOBIOLOGY TEXTBOOK
Nové kniha vznikala pod záštitou Evropské společnosti pro výzkum záření (ERRS) a pracovala na ni asi stovka autorů.
Kniha vyplňuje dlouho existující mezeru po přehledové knize a učebnici v oboru. Jedná se o nejnovější učebnici (1. vydání) poskytující nejen základní znalosti z radiobiologie, které by měl znát každý vysokoškolský student, ale také o knihu shrnující přehledovým způsobem nejdůležitější širší spektrum rozšiřujících se informací o pokrocích v širokém spektru radiobiologických a (radio)lékařských oborů.
Výklad je doprovázen četnými ilustracemi a reálnými výzkumnými daty a základní znalosti, které by měl čtenář po přečtení kapitoly získat, jsou zvýrazněny a shrnuty formou přehledných tabulek.
Kniha má přibližně 600 stran, vyšla v nakladatelství Springer a je k dispozici ke stažení ZDARMA v elektronické podobě ZDE. V tištěné podobě ji lze zakoupit tamtéž za 53,49 eur (pevná vazba) nebo levněji (měkká vazba).
IBP career day: Per Aspera Ad Astra 2023
26. 9. 2023
Young researchers of the Institute of Biophysics (IBP) of the Czech Academy of Sciences are inviting students and postdocs to IBP career day: Per Aspera Ad Astra focused on future career possibilities in the academic and industrial spheres. During the event, four outstanding scientists will share stories of their scientific journeys and will lead popular round table discussions on various topics.
Date & Location: 09.11.2023, Lecture Hall at the Institute of Biophysics
Confirmed speakers:
Kateřina Rohlenová is a junior group leader at the Institute of Biotechnology, CAS, in BIOCEV in Prague. After her Ph.D. at the same institute, where she characterized a novel anti-cancer drug that later underwent a phase I clinical trial, she moved to VIB in Leuven, Belgium, to study the metabolism of endothelial cells. In 2020, she returned to the Czech Republic to establish a Cellular Metabolism group. With a team of 12 researchers (7 nationalities), she studies intercellular metabolic communication in tumors. Her research is funded by an ERC Starting grant and EMBO Installation grant, among others.
Frank Schestag is commercial director at Europe Proteintech Group & General Manager of Proteintech GmbH Germany and ChromoTek GmbH. Before coming to Proteintech, Dr. Schestag received his Ph.D. in Biochemistry at the Christian-Albrechts-University in Kiel. Afterward, he began his career at Fermentas, a manufacturer of molecular biology products. In large part due to Dr. Schestag’s stewardship, Fermentas accelerated in growth and was acquired by Thermo Fisher, where he transitioned to General Manager and Site Leader.
Pavla Hubálková is a science journalist at Charles University. She also writes about science for various online and print media. She originally thought she would become a scientist. She studied clinical biochemistry at the University of Chemistry and Technology in Prague and completed her Ph.D. in neuroscience at the Third Faculty of Medicine, Charles University. During her Fulbright internship at Northwestern University in Chicago, however, she discovered that she wanted to work in science communication.
Aleš Pečinka is a group leader at the Centre of Plant Structural and Functional Genomics of the Institute of Experimental Botany, CAS, in Olomouc. He studies the role of chromatin in epigenetic regulation and maintenance of genome stability in plants. After his Ph.D. studies at the Leibnitz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (DE), he went for a post-doc at the Gregor Mendel Institute of Plant Molecular Biology in Vienna (AT). Then he established his own research direction as a group leader at the Max Planck Institute for Plant Breeding Research in Cologne (DE). Proud father of two, an enthusiastic badminton player, and a gardener.
Program:
12:30-13:00 registration
13:00-13:10 introduction by Hana Polasek-Sedlackova on behalf of the organization team
13:10-13:40 Navigating the Unknown: My Journey to Becoming a Group Leader by Kateřina Rohlenová,
group leader at the Institute of Biotechnology, Czech Academy of Sciences,
chair: Anoop Kumar Yadav
13:40-14:10 Guidelines to be successful in your first interviews by Frank Schestag,
commercial director at Europe Proteintech Group & general manager of Proteintech
GmbH Germany and ChromoTek,
chair: Soňa Legartová
14:10-14:30 coffee break
14:30-15:00 Science and the media: a win-win relationship by Pavla Hubálková,
science journalist at Charles University,
chair: Tomáš Perečko
15:00-15:30 How to enjoy a career in science: A critical mid-term review by Aleš Pečinka,
group leader at the Institute of Experimental Botany, Czech Academy of Sciences,
chair: Pavla Novotná
15:30-15:45 coffee break
15:45-16:45 round table discussions
from 16:45 networking with beer and pizza
Round table discussions topics:
Registration:
Registration is free of charge. By registering you, are helping us to better estimate the number of people that will attend and the food & drinks needed. Thank you for your registration!
Registration deadline: 5th November 2023
Registration form can be found here.
