Výzkumné týmy
Výzkum na pracovišti probíhá zejména na základě výzkumných týmů. Celkový počet a velikost týmů nejsou omezeny.

Komparativní a transnacionální dějiny
Vedoucí týmu: doc. Dr. phil. Rudolf Kučera, Ph.D.

Konstruování československé státnosti: koncepty – strategie – reflexe
Vedoucí týmu: PhDr. Dagmar Hájková, Ph.D.

Manuscripta. Studium a soupis rukopisů
Vedoucí týmu: PhDr. Marta Hradilová, Ph.D.

Tomáš Garrigue Masaryk a jeho spolupracovníci
Vedoucí týmu: Mgr. Milan Hanyš, Ph.D.

Transformace státu a společnosti v hospodářské a sociální perspektivě
Vedoucí týmu: doc. PhDr. Martin Jemelka, Ph.D.

Věda a vědec ve společnosti
Vedoucí týmu: doc. PhDr. Martin Franc, Ph.D.