Metabolismus bioaktivních lipidů
Oddělení se zaměřuje na analýzu lipidových mediatorů (eikosanoidů, docosanoidů, endocannabinoidů) v tukové tkáni pomocí metody UPLC-MS/MS, především na identifikaci zdroje produkce jednotlivých mediátorů a jejich vliv na metabolismus a zánětlivé vlastnosti buněk tukové tkáně (adipocyty vs. makrofágy). V současné době zkoumá antidiabetické lipidy z rodiny větvených esterů hydroxymastných kyselin. Dále jsou rozvíjeny nové metody pro studování metabolismu a metabolických drah pomocí platformy LIMeX.
V případě zájmu o Bc., Mgr., Ing. nebo Ph.D. práci v oblasti biochemie, analytické chemie, fyziologie nebo příbuzných oborů pošlete, prosím, email ohledně možných témat a jejich vypsání. Témata se dynamicky mění.
GTTAtlas - interaktivní metabolomický a lipidomický atlas myších tkání během orálního glukózového tolerančního testu (OGTT).
MetaboAtlas21 - zevrubný atlas myšího metabolomu a lipidomu.
LORA - a Lipid Over-Representation Analysis tool.
Téma bakalářské práce: Analýza vzniku ketolátek během lipogeneze pomocí LC-MS (PřF UK 2022/2023+, Analytická chemie)
Téma diplomové práce: Analýza vzniku a metabolismu ketolátek pomocí LC-MS (PřF UK 2022/2023+, Analytická chemie)
Aktuální projekty
Software:
GTTAtlas
MetaboAtlas21
Mapper
Reaction network viewer
LORA
a výběr speciálních metod z oblasti metabolomiky, lipidomiky a fluxomiky.
Více
Bílá tuková tkáň (WAT) je komplexní endokrinní orgán a subklinický zánět této tkáně během obezity přispívá s rozvoji metabolických onemocnění. V roce 2014 byla objevena nová třída lipidových mediátorů pocházejících z WAT – větvené estery oxidovaných mastných kyselin (FAHFA). FAHFA jsou endogenní lipidy s protizánětlivými a antidiabetickými vlastnostmi, včetně zvýšení glukózové tolerance a sekrece inzulínu a glukagonu podobného peptidu 1 (GLP-1) při současném snížení zánětlivých odpovědí [1-5].
Více
Přirozeně se vyskytující omega-3 PUFA s dlouhým řetězcem, jmenovitě kyselina eikosapentaenová (EPA; 20: 5 co-3), kyselina dokosapentaenová (DPA; 22: 5 co-3) a kyselina dokosahexaenová (DHA; 22: 6 co-3) vykazují více biologických účinků ...
Více
Naše laboratoř se účastní projektu Otevřená věda s projekty...
Více
We run local instances of several services focused on Metabolomics, Lipidomics, Statistical analysis and Chemometrics. As the hardware resources are limited, these tools are available only within campus LAN.
Více
Zobrazit více
Úspěchy
Více
Více
Grant GA20-00317S Nové metabolické dráhy syntézy antidiabetických lipokinů (2020-2022) byl udělen naší laboratoři.
Více
Akademie věd ČR rozjíždí velkorysý program dotací pro úspěšné vědce a vědkyně mladší a střední generace s mezinárodními zkušenostmi. Prémie Lumina quaeruntur finančně podpoří perspektivní badatele, kteří si můžou sestavit svůj vlastní výzkumný tým na dobu až pěti let. Akademie věd představila program i jeho prvních šest laureátů na slavnostním ceremoniálu na Národní třídě ve čtvrtek 17. ledna.
Prvními nositeli stipendia je šest vědců z různorodých oborů, přičemž šanci mají i zahraniční vědci, kteří působí v rámci Akademie věd ČR. Mezi oceněnými je i Ondřej Kuda, specialista na metabolismus bioaktivních lipidů, který úzce souvisí s výzkumem cukrovky 2. typu.
Lumina Quaeruntur
Více
Publikace
Šiklová; M. - Šrámková; V. - Koc; M. - Krauzová; E. - Čížková; T. - Ondrůjová; B. - Wilhelm; M. - Varaliová; Z. - Kuda; Ondřej - Neubert; J. - Lambert; L. - Elkalaf; M. - Gojda; J. - Rossmeislová; L.
The role of adipogenic capacity and dysfunctional subcutaneous adipose tissue in the inheritance of type 2 diabetes mellitus: cross-sectional study
.
Obesity. 2024; 32(3); 547-559
.
IF = 6.9
[ASEP]
[
doi
]
Čajka; Tomáš - Hricko; Jiří - Rakušanová; Stanislava - Brejchová; Kristýna - Nováková; Michaela - Rudl Kulhavá; Lucie - Holá; Veronika - Paučová; Michaela - Fiehn; O. - Kuda; Ondřej
.
Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography–Hydrogen/Deuterium Exchange–Mass Spectrometry (HILIC-HDX-MS) for Untargeted Metabolomics
.
International Journal of Molecular Sciences. 2024; 25(5); 2899
.
IF = 5.6
[ASEP]
[
doi
]
Vondráčková; Michaela - Kopczynski; D. - Hoffmann; N. - Kuda; Ondřej
.
LORA; Lipid Over-Representation Analysis Based on Structural Information
.
Analytical Chemistry. 2023; 95(34); 12600-12604
.
IF = 7.4
[ASEP]
[
doi
]
Song; J. - Duivenvoorde; L. P. M. - Grefte; S. - Kuda; Ondřej - Martínez-Ramírez; Felipe - van der Stelt; I. - Mastorakou; D. - van Schothorst; E. M. - Keijer; J.
Normobaric hypoxia shows enhanced FOXO1 signaling in obese mouse gastrocnemius muscle linked to metabolism and muscle structure and neuromuscular innervation
.
Pflugers Archiv - European Journal of Physiology. 2023; 475(11); 1265-1281
.
IF = 4.5
[ASEP]
[
doi
]
Martínez-Ramírez; Felipe - Riečan; Martin - Čajka; Tomáš - Kuda; Ondřej
.
Analysis of fatty acid esters of hydroxy fatty acids in edible mushrooms
.
LWT-Food Science and Technology. 2023; 173(1 Jan)); 114311
.
IF = 6.0
[ASEP]
[
doi
]
Hricko; Jiří - Rudl Kulhavá; Lucie - Paučová; Michaela - Nováková; Michaela - Kuda; Ondřej - Fiehn; O. - Čajka; Tomáš
.
Short-Term Stability of Serum and Liver Extracts for Untargeted Metabolomics and Lipidomics
.
Antioxidants. 2023; 12(5)); 986
.
IF = 7.0
[ASEP]
[
doi
]
Drastichová; Z. - Trubačová; Radka - Novotný; J.
Regulation of phosphosignaling pathways involved in transcription of cell cycle target genes by TRH receptor activation in GH1 cells
.
Biomedicine & Pharmacotherapy. 2023; 168(Dec); 115830
.
IF = 7.5
[ASEP]
[
doi
]
Čajka; Tomáš - Hricko; Jiří - Rudl Kulhavá; Lucie - Paučová; Michaela - Nováková; Michaela - Kuda; Ondřej
.
Optimization of Mobile Phase Modifiers for Fast LC-MS-Based Untargeted Metabolomics and Lipidomics
.
International Journal of Molecular Sciences. 2023; 24(3)); 1987
.
IF = 5.6
[ASEP]
[
doi
]
Čajka; Tomáš - Hricko; Jiří - Rudl Kulhavá; Lucie - Paučová; Michaela - Nováková; Michaela - Fiehn; O. - Kuda; Ondřej
.
Exploring the Impact of Organic Solvent Quality and Unusual Adduct Formation during LC-MS-Based Lipidomic Profiling
.
Metabolites. 2023; 13(9); 966
.
IF = 4.1
[ASEP]
[
doi
]
Castillo; P. - Kuda; Ondřej - Kopecký; Jan - Pomar; C. A. - Palou; A. - Palou; M. - Picó; C.
Stachydrine; iN/i-acetylornithine and trimethylamine N-oxide levels as candidate milk biomarkers of maternal consumption of an obesogenic diet during lactation
.
Biofactors. 2023; 49(5); 1022-1037
.
IF = 6.0
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
Zobrazit více
Kristyna Magno Ondrej Veronika Marina
Speedvac
Growing cells
QTRAP 5500 / SelexION
Growing cells
Solid Phase Extraction
