Bioanalytická servisní laboratoř
Souhrn
Rostliny hrají v životě člověka nezastupitelnou roli. Růst a vývoj rostlin a jejich reakce na biotické a abiotické podněty jsou do značné míry závislé na skupině malých molekul nazývaných rostlinné hormony nebo též fytohormony. Různé typy fytohormonů jsou schopny i v nepatrném množství specificky ovlivňovat jednotlivé fyziologické procesy v rostlinách. Například auxiny, cytokininy a gibereliny jsou zodpovědné za růst a vývoj rostlin, kyselina abscisová je spojena s reakcemi na stres a kyseliny salicylová a jasmonová hrají roli v obraně rostlin proti býložravcům a chorobám. Význam fytohormonů v životě rostlin se odráží i v lidských snahách ovlivňovat jejich hladiny, a to buď geneticky nebo chemicky. Kromě přirozeně se vyskytujících fytohormonů existuje i řada syntetických forem fytohormonů hojně používaných v zemědělství, které napodobují účinky přirozených fytohormonů. Znalost koncentrací fytohormonů je nezbytná pro pochopení základních mechanismů působení fytohormonů na rostliny, ale také v zemědělství pro zlepšení kvality a výnosu plodin.
Náš přístup
Kvantifikace fytohormonů představuje řadu výzev. Fytohormony jsou chemicky rozmanité, od zásad přes neutrální až po slabé kyseliny; od polárních až po hydrofobní. Jejich přirozený výskyt v rostlinách je velmi nízký, pohybuje se v rozmezí mezi femto až pikomolárními koncentracemi. Nejnovější trendy v analýze fytohormonů směřují ke zvyšování počtu analyzovaných sloučenin, včetně aktivních fytohormonů, jejich prekurzorů a metabolitů. Takovýto přístup komplexnější analýzy souboru sloučenin, nám umožňuje lépe pochopit biochemické procesy, kterými fytohormony procházejí. Všechny tyto vlastnosti fytohormonů jako jejich chemická rozmanitost, nízké koncentrace a velký počet metabolitů a prekurzorů, musí být řešeny kvantitativním analytickým přístupem. V naší laboratoři používáme kombinaci mikro extrakce, purifikace extrakcí na pevné fázi (SPE) a instrumentální analýzy na ultra-vysokoúčinné kapalinové chromatografii (UHPLC) spojené s hmotnostní detekcí, s trojitým kvadrupólem (QQQ-MS) nastaveným v režimu monitorování vícenásobných reakcí (MRM). Umožňuje nám analyzovat více sloučenin (více než 100) v jednom vzorku s vysokou specifičností a citlivostí. Tato technika také umožňuje podle potřeby rozšiřovat seznam měřených sloučenin o nové biologicky relevantní a zajímavé sloučeniny.
Náš tým
Petre Dobrev
Vedoucí laboratoře, SPE, LCMS, analýza dat
Roberta Vaculiková
Příprava vzorků, SPE, LCMS, analýza dat
Jozef Lacek
LCMS, analýza dat
Barbora Svobodová
Příprava vzorků, SPE, analýza dat
Kontakt
Ing. Petre I. Dobrev PhD.
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Bioanalytická servisní laboratoř
Rozvojová 263
165 02 Praha 6
Česká republika
tel: +420 225 106 444
E-mail: dobrev@ueb.cas.cz