Česká verze English version

Časopis pro popularizaci biologie, založil roku 1853 J.E. Purkyně

Jak se hledají geny. Genomika a bioinformatika

Pačes J.

Počítačová analýza genomu při hledání genů zahrnuje převedení sledu nukleotidů v molekule DNA do počítače, dělení získané sekvence na trojice nukleotidů kódující jednotlivé aminokyseliny a seskupování těchto kodónů do celků, které kódují proteiny a tvoří tak konkrétní geny. Geny lze identifikovat pomocí příbuznosti, statistiky nebo entropie. U vyšších organismů s komplikovanou strukturou genomu však zmíněné počítačové metody nepostačují a musejí se kombinovat s metodami experimentálními.


str. 198

Schematické znázornění výsledků generovaných programem BLAST, který je určen pro hledání příbuzných sekvencí DNA nebo proteinu v databázi. Na obr. je vidět analýza DNA o délce asi 5 000 písmen - nukleotidů (jasně červená úsečka v horní části obr.). Barevné úsečky ve spodní části obrázku ukazují, ke kterým úsekům analyzované DNA existuje v databázi DNA podobná. Barvou je znázorněna míra této podobnosti (červená - nejvíce podobná, černá - nejméně podobná, číselně vyjádřeno v horní části obrázku). Orig. J. Pačes

Schematické znázornění výsledků generovaných programem BLAST, který je určen pro hledání příbuzných sekvencí DNA nebo proteinu v databázi. Na obr. je vidět analýza DNA o délce asi 5 000 písmen - nukleotidů (jasně červená úsečka v horní části obr.). Barevné úsečky ve spodní části obrázku ukazují, ke kterým úsekům analyzované DNA existuje v databázi DNA podobná. Barvou je znázorněna míra této podobnosti (červená - nejvíce podobná, černá - nejméně podobná, číselně vyjádřeno v horní části obrázku). Orig. J. Pačes