PRACOVNÍ SKUPINA PRO STRUKTURNÍ ANALÝZU MOLEKUL

Pracovní skupina pro strukturní analýzu molekul

Vedoucí: RNDr. Jindřich Hašek, DrSc. (tel. 296 809 205, e-mail: hasek@imc.cas.cz)

Výzkum

Metodika

• Experimentální stanovení makromolekulárních struktur v atomovém rozlišení
• Sledování procesů probíhajících v makromolekulárních systémech na nanosekundové úrovni s použitím synchrotronového záření
• Teoretické studium makromolekulárních a supramolekulárních systémů
• Dynamika makromolekul
• Mezimolekulární interakce a vzájemné rozpoznávání molekul
• Analýza vztahů mezi strukturou a funkcí v makromolekulárních systémech

Zkoumané materiály:

• Struktura a funkce biopolymerů
• Detailní analýza interakcí v komplexech HIV proteázy, návrh optimálních inhibitorů pro léčbu AIDS)
• Analýza struktury komplexů tvořených mutanty HIV-1 proteázy vznikajícími v důsledku léčby
• Struktura a funkce syntetických polymerů v krystalické fázi
• Molekulární struktura sloučenin modifikujících vlastnosti makromolekulárních systémů

Experimentální zařízení, počítače a software

• Rtg difraktometry firmy Siemens pro strukturní analýzu molekul
• Zařízení pro krystalizaci biologických makromolekul (proteiny, peptidy)
• Počítače: grafické stanice SGI O2 R5000 IRIX, Alpha speciály 600 MHz LINUX a několik PC (NT, LINUX)
• Chemický software (Tinker, Dock, Alpha shapes, Molscript, Rasmol, Insight, Discover, atd.)
• Software pro stanovení struktury makromolekul (programové balíky: HKL, CCP4, X-PLOR, O, SHELX, XtalView, atd.)
• Strukturní databáze:
  • polymery (PolyBase),
  • proteiny (PDB, WPDB),
  • organické a organometalické sloučeniny (CCDC),
  • intermolekulární interakce (Star),
  • HIV proteázy, HIV mutanty, inhibitory HIV

Umístění v ÚMCH AV ČR: Laboratoře č. 301 a 323, tel. 296809205, 296809390, fax: 296809410, 6521950

Připomínky lze zaslat na adresu:
hasek@imc.cas.cz
Naposled upraveno: 14.01.2009