PRACOVNI SKUPINA PRO STRUKTURNI ANALYZU MOLEKUL

Pracovni skupina pro strukturni analyzu molekul

Vedouci: RNDr. Jindrich Hasek, DrSc. (tel. 296 809 205, e-mail: hasek@imc.cas.cz)

Vyzkum

Metodika

• Experimentalni stanoveni makromolekularnich struktur v atomovem rozliseni
• Sledovani procesu probihajicich v makromolekularnich systemech na nanosekundove urovni s pouzitim synchrotronoveho zareni
• Teoreticke studium makromolekularnich a supramolekularnich systemu
• Dynamika makromolekul
• Mezimolekularni interakce a vzajemne rozpoznavani molekul
• Analyza vztahu mezi strukturou a funkci v makromolekularnich systemech

Zkoumane materialy:

• Struktura a funkce biopolymeru
• Detailni analyza interakci v komplexech HIV proteazy, navrh optimalnich inhibitoru pro lecbu AIDS)
• Analyza struktury komplexu tvorenych mutanty HIV-1 proteazy vznikajicimi v dusledku lecby
• Struktura a funkce syntetickych polymeru v krystalicke fazi
• Molekularni struktura sloucenin modifikujicich vlastnosti makromolekularnich systemu

Experimentalni zarizeni, pocitace a software

• Rtg difraktometry firmy Siemens pro strukturni analyzu molekul
• Zarizeni pro krystalizaci biologickych makromolekul (proteiny, peptidy)
• Pocitace: graficke stanice SGI O2 R5000 IRIX, Alpha specialy 600 MHz LINUX a nekolik PC (NT, LINUX)
• Chemicky software (Tinker, Dock, Alpha shapes, Molscript, Rasmol, Insight, Discover, atd.)
• Software pro stanoveni struktury makromolekul (programove baliky: HKL, CCP4, X-PLOR, O, SHELX, XtalView, atd.)
• Strukturni databaze:
  • polymery (PolyBase),
  • proteiny (PDB, WPDB),
  • organicke a organometalicke slouceniny (CCDC),
  • intermolekularni interakce (Star),
  • HIV proteazy, HIV mutanty, inhibitory HIV

Umisteni v UMCH AV CR: Laboratore c. 301 a 323, tel. 296809205, 296809390, fax: 296809410, 6521950

Pripominky lze zaslat na adresu:
hasek@imc.cas.cz
Naposled upraveno: 14.01.2009