doc. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D.

Pozice: vedoucí
Zaměření: Molekulární ekologie
Oddělení: Oddělení populační biologie
Telefon: +420 568 422 387
E-mail: bryjabrno.cas.cz

Oblasti vědeckého zájmu:

Molekulární ekologie obratlovců (genetická struktura populací, vztah neutrální a adaptivní variability, imunogenetika, ochranářská genetika, analýzy paternity a reprodukčního úspěchu u ryb, ptáků a savců)

Ekologie savců, zejména hlodavců (determinanty populačního poměru pohlaví, dynamika cyklických populací, struktura společenstev)

Fylogeografie, taxonomie a fylogenetika různých skupin živočichů (Rodentia, Chiroptera, Hemiptera)

Vzdělání:

1992-2000 - Přírodovědecká fakulta MU, Brno

1992-1997 – Magisterské studium: Systematická biologie a ekologie (zaměřeno na zoologii a ekologii savců). Diplomová práce: Struktura synuzií drobných zemních savců v různých biotopech CHKO Poodří. (Mgr.; vedoucí Z. Řehák)

1993-1998 – Magisterské studium: Molekulární biologie a genetika (zaměřeno na efekt onkogenů na diferenciaci a proliferaci buněk). Diplomová práce: Příprava zkrácené varianty genu pro retinoidový receptor RXR alpha a jeho přenos do monoblastové linie BM2. (Mgr.; vedoucí J. Šmarda)

1997-2000 – Postgraduální studium: Zoologie (zaměřeno na populační dynamiku hrabošovitých hlodavců). Doktorská práce: Demografická charakteristika populace hraboše polního (Microtus arvalis) na jižní Moravě (Ph.D.; školitel J. Gaisler)

Zaměstnání:

1997-2000: Ústav biologie obratlovců AV ČR, odborný VŠ pracovník

2001-2010: Ústav biologie obratlovců AV ČR, vědecký pracovník, zodpovědný za provoz Laboratoře molekulární genetiky na Oddělení populační biologie ÚBO AV ČR ve Studenci

2004-2006: Post-doktorand, Centre de Biologie et Gestion des Populations, Montferriez sur Lez, Francie

2003-2009: Ústav botaniky a zoologie, PřF MU, odborný pracovník (částečný úvazek)

2009-dosud: Docent (částečný úvazek), Ústav botaniky a zoologie, PřF MU - přednášky Molekulární ekologie (od r. 2009 spolu s M. Macholánem), Genetické metody v zoologii (spolu s M. Macholánem), Pokroky v biologii obratlovců - seminář (spolu se Z. Řehákem), školitel bakalářských, magisterských a postgraduálních studentů

od 2010: vedoucí Oddělení populační biologie ÚBO AV ČR, v.v.i.

od 2011: vědecký tajemník ÚBO AV ČR, v.v.i.

Vědecká a organizační činnost:

pravidelný hlavní organizátor největší česko-slovenské zoologické konference Zoologické dny (zoo.ivb.cz)

recenzent odborných časopisů, např. Acta Chiropterologica, Acta Theriologica, African Journal of Ecology, Animal Conservation, Annales Zoologici Fennici, Biologia (Bratislava), Biological Journal of the Linnean Society, Biology Direct, Biology Letters, Canadian Journal of Zoology, Conservation Genetics, Entomologica Fennica, Folia Zoologica, Genes and Immunity, Heredity, Immunogenetics, Journal of Zoology, Klapalekiana, Mammalia, Mammalian Biology, Molecular Ecology, Oikos, Sylvia.

oponent závěrečných prací a člen zkušebních komisí v České republice (PřF MU v Brně, PřF JU v Českých Budějovicích, PřF UP v Olomouci, PřF UK v Praze), na Slovensku (PřF UK v Bratislavě) a ve Francii (Universtité Montpellier II, MNHN Paris)

člen oborové komise doktorandského studijního programu Zoologie na PřF MU v Brně

dosud školitel nebo konzultant 15 magisterských studentů (PřF MU Brno, PřF JU České Budějovice, Université Montpellier II) a 10 Ph.D. studentů (PřF MU Brno a PřF JU České Budějovice)

Mezinárodní zkušenosti a spolupráce:

2000: Laboratoire de Genome, Population et Interaction, Université Montpellier II, Francie (P. Boursot, B. Dod). Vědecká stáž, 2 měsíce.

2004-2006: Centre de Biologie et Gestion des Populations, INRA, Montferriez-le-Lez, France (J.F. Cosson, N. Charbonnel). Post-doc stáž, 3 pobyty, celkem 11 měsíců.

2004-2008: Niokolo Koba National Park, Senegal - účast na pětiletém projektu "Diverzita a ekologie vybraných skupin obratlovců západní Afriky". Spolupráce s francouzskými partnery: J.M. Duplantier, L. Granjon, J.F. Cosson, V. Nicolas, E. Lecompte, G. Dobigny

2004-2009: zástupce České republiky v mezinárodním řídícím výboru vědeckého programu European Science Foundation "Integrating population genetics and conservation biology: Merging theoretical, experimental and applied approaches"

září 2008: organizace Letní školy ochranářské genetiky v Liblicích (ESF ConGen) za účasti studentů a školitelů z 19 evropských zemí

2005-2009: školitel doktoranda pod dvojím vedením (A. Konečný; ve spolupráci s Université Motpellier II, Francie)

2009-dosud: zástupce České republiky v konsorciu CONGRESS (Conservation of Genetic Resources for Effective Species Survival), projekt 7RP EU

2010-2013: školitel doktoranda pod dvojím vedením (A. Fornůsková; ve spolupráci s Université Motpellier II, Francie)

Současní PhD studenti:

Barbora Zemanová: Conservation genetics of chamois in Central Europe

Radka Poláková: Genetic factors affecting mate choice and reproductive factors in the Scarlet Rosefinch (konzultant T. Albrecht)

Dagmar Čížková: Major histocompatibility complex variation in the house mice hybrid zone

Marta Promerová: MHC-based mate choice in the Scarlet Rosefinch (konzultant T. Albrecht)

Štěpánka Říčanová: Conservation genetics and phylogeography of ground squirrels (= školitel-specialista; školitel F. Sedláček)

Hana Patzenhauerová: Factors affecting genetic structure of selected rodents in eastern Africa

Alena Fornůsková: The role of innate immunity genes in evolutionary ecology of rodents

Wasimuddin: Genetic variation of pathogens in the house mice hybrid zone (konzultanti J. Gouy de Bellocq and J. Piálek)

Současní bakalářští a magisterští studenti:

Mwanahamisi Issa Mapua: Genetická analýza šimpanzů v českých a slovenských zoologických zahradách (Mgr. práce)

Tereza Králová: Variabilita MHC genů a její vliv na fitness u koroptve polní (Mgr. práce)

Pavlína Opatová: Innate and acquired immunity and their role in mate choice in galliform birds (Bc. práce)

Markéta Jandová: Optimalizace setu mikrosatelitů pro tři kryptické druhy netopýrů rodu Myotis (Bc. práce)

Veronika Bartáková: Detailní populačně-genetická struktura hořavky duhové ve střední Evropě (Bc. práce)

Petra Kašparová: Hlodavci Zambie (Bc. práce)

Monika Hloušková: Přehled dosavadních poznatků o afrických hlodavcích rodu Aethomys (Bc. práce)

Bývalí PhD. studenti:

Hájková Petra, 2008: Conservation genetics of the Eurasian otter. ÚBZ PřF MU, Brno. (konzultant, školitel P. Jurajda)

Konečný Adam, 2009: Consequences of anthropogenic changes on rodent communities and populations: study cases on native and introduced species in Eastern Senegal. ÚBZ PřF MU, Brno a Université Montpellier II. (školitel, spolu s J.M. Duplantier; doktorát pod dvojím vedením) )

Bývalí Mgr. studenti:

Kernstocková Markéta, 2002: Skladba potravy sovy pálené (Tyto alba) v hnízdním období a její vliv na hnízdní úspěšnost. Diplomová práce, KZE PřF MU, Brno.

Bémová Petra, 2005: Genetická struktura populací netopýra velkého (Myotis myotis) v okolí Moravského krasu. Diplomová práce, KZ PřF JU, České Budějovice.

Bencová Věra, 2005: Sezónní změny skladby potravy kalouse ušatého (Asio otus) na jižní Moravě. Diplomová práce, KZE PřF MU, Brno.

Konečný Adam, 2005: Variabilita sekundárního poměru pohlaví ve volně žijících populacích hraboše polního (Microtus arvalis). Diplomová práce, KZE PřF MU, Brno.

Zemanová Barbora, 2006: Stanovení početnosti a struktury populace vydry říční (Lutra lutra) v CHKO & BR Třeboňsko využitím neinvazivní genetické metody. Diplomová práce, KZE PřF MU, Brno.

Dařenová Eva, 2006: Sociální modulace množství močových proteinů u myšice malooké a myšice temnopásé. Diplomová práce, ÚBZ PřF MU, Brno.

Tollenaere Charlotte, 2006: Sélection balancée par les parasites sur le Complexe Majeur d´Histocompatibilité: Détection et mecanismes dans le cas du gene DQA classe II chez un campagnol a demographie cyclique. Master 2 Recherche, Université Montpellier II. (vedeno dohromady s N. Charbonnel)

Promerová Marta, 2007: The role of MHC genes in the mate choice in the Scarlet rosefinch (Carpodacus erythrinus). Diplomová práce, ÚBZ PřF MU, Brno.

Patzenhauerová Hana, 2007: Příbuzenská struktura a paternita v přírodní populaci solitérního rypoše Heliophobius argenteocinereus. Diplomová práce, ÚBZ PřF MU, Brno.

Blažková Pavla, 2009: Fenotypové charakteristiky a úspěšnost párování koroptve polní (Perdix perdix). KZ PřF JU, České Budějovice.

Fornůsková Alena, 2009: Population genetic structure of two cryptic species of the genus Pipistrellus in Central Europe. ÚBZ PřF MU, Brno a Université de Rennes. (vedeno dohromady s E. Petit)

Projekty

Biologie rypošovitých z mezických tropických oblastí (2008-2011)

Srovnávací fylogeografie jihovýchodní Afriky (region Zambezi) na modelu drobných savců (2010-2014)

Ochranářská genetika vybraných obratlovců západního Balkánu (2008-2009)

Genetická struktura populací perlorodky říční v České republice (2009-2010)

Vnitrodruhová variabilita populací dvou kryptických druhů netopýrů rodu Pipistrellus ve střední Evropě (2006-2008)

Role MHC v sexuální selekci - observační a experimentální studie u tří modelových druhů obratlovců (2006-2008)

Toll-like receptory u pěvců: popis, polymorfismus a evoluční důsledky alelické variability (2010-2014)

Publikace

2011

D. ČÍŽKOVÁ, J. GOÜY DE BELLOCQ, S. J. E. BAIRD, J. PIÁLEK, J. BRYJA: Genetic structure and contrasting selection pattern at two major histocompatibility complex genes in wild house mouse populations, Heredity 106 (2011) 727-740.

D. DEMONTIS, S. D. CZARNOMSKA, P. HÁJKOVÁ, B. ZEMANOVÁ, J. BRYJA, V. LOESCHCKE, C. PERTOLDI: Characterization of 151 SNPs for population structure analysis of the endangered Tatra chamois (Rupicapra rupicapra tatrica) and its relative, the Alpine chamois (R. r. rupicapra), Mammalian Biology 76 (2011) 644-645.

E. JÁNOVÁ, M. HEROLDOVÁ, A. KONEČNÝ, J. BRYJA: Traditional and diversified crops in South Moravia (Czech Republic): Habitat preferences of common vole and mice species, Mammalian Biology 76 (2011) 570-576.

P. PROCHÁZKA, B. G. STOKKE, H. JENSEN, D. FAINOVÁ, E. BELLINVIA, F. FOSSOY, J. R. VIKAN, J. BRYJA, M. SOLER: Low genetic differentiation among reed warbler Acrocephalus scirpaceus populations across Europe, Journal of avian biology 42 (2011) 103-113.

M. PROMEROVÁ, W. BABIK, J. BRYJA, T. ALBRECHT, M. STUGLIK, J. RADWAN: Evaluation of two approaches to genotyping major histocompatibility complex class I in a passerine—CE-SSCP and 454 pyrosequencing, Molecular Ecology Resources (2011) .

M. PROMEROVÁ, M. VINKLER, J. BRYJA, R. POLÁKOVÁ, J. SCHNITZER, P. MUNCLINGER, T. ALBRECHT: Occurrence of extra-pair paternity is connected to social male’s MHC-variability in the scarlet rosefinch Carpodacus erythrinus, Journal of avian biology 42 (2011) 5-10.

M. REICHARD, J. BRYJA, M. POLAČIK, C. SMITH: No evidence for host specialization or host-race formation in the European bitterling (Rhodeus amarus), a fish that parasitizes freshwater mussels, Molecular Ecology 20 (2011) 3631-3643.

Š. ŘÍČANOVÁ, J. BRYJA, J.-F. COSSON, C. GEDEON, L. CHOLEVA, M. AMBROS, F. SEDLÁČEK: Depleted genetic variation of the European ground squirrel in Central Europe in both microsatellites and the major histocompatibility complex gene: implications for conservation, Conservation Genetics 12 (2011) 1115-1129.

B. ZEMANOVÁ, P. HÁJKOVÁ, J. BRYJA, J. ZIMA JR., A. HÁJKOVÁ, J. ZIMA: Development of multiplex microsatellite sets for noninvasive population genetic study of the endangered Tatra chamois, Folia zoologica 60 (2011) 70-80.

2010

M. AGBALI, M. REICHARD, A. BRYJOVÁ, J. BRYJA, C. SMITH: Mate choice for nonadditive genetic benefits correlate with MHC dissimilarity in the rose bitterling (Rhodeus ocellatus), Evolution 64 (2010) 1683-1696.

T. BARTONIČKA, P. KAŇUCH, B. BÍMOVÁ, J. BRYJA: Olfactory discrimination between two cryptic species of bats Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus, Folia zoologica 59 (2010) 175-182.

J. BRYJA, C. SMITH, A. KONEČNÝ, M. REICHARD: Range-wide population genetic structure of the European bitterling (Rhodeus amarus) based on microsatellite and mitochondrial DNA analysis, Molecular Ecology 19 (2010) 4708-4722.

J. BRYJA, L. GRANJON, G. DOBIGNY, H. PATZENHAUEROVÁ, A. KONEČNÝ, J.-M. DUPLANTIER, P. GAUTHIER, M. COLYN, L. DURNEZ, A. LALIS, V. NICOLAS: Plio-Pleistocene history of West African Sudanian savanna and the phylogeography of the Praomys daltoni complex (Rodentia): the environment/geography/genetic interplay, Molecular Ecology 19 (2010) 4783-4799.

J. BRYJA, M. UHRIN, P. KAŇUCH, P. BÉMOVÁ, N. MARTÍNKOVÁ, J. ZUKAL: Mitochondrial DNA confirms low genetic variation of the greater mouse-eared bats, Myotis myotis, in Central Europe, Acta Chiropterologica 12 (2010) 73-81.

E. V. BUŽAN, B. KRYŠTUFEK, J. BRYJA: Microsatellite markers confirm extensive population fragmentation of the endangered Balkan palaeoendemic Martino’s vole (Dinaromys bogdanovi), Conservation Genetics 11 (2010) 1783-1794.

M. HEROLDOVÁ, M. PEJČOCH, J. BRYJA, E. JÁNOVÁ, J. SUCHOMEL, E. TKADLEC: Tula virus in populations of small terrestrial mammals in a rural landscape, Vector-Borne and Zoonotic Diseases 10 (2010) 599-603.

P. HULVA, A. FORNŮSKOVÁ, A. CHUDÁRKOVÁ, A. EVIN, B. ALLEGRINI, P. BENDA, J. BRYJA: Mechanisms of radiation in a bat group from the genus Pipistrellus inferred by phylogeography, demography and population genetics, Molecular Ecology 19 (2010) 5417-5431.

N. CHARBONNEL, J. BRYJA, M. GALAN, J. DETER, C. TOLLENAERE, Y. CHAVAL, S. MORAND, J.-F. COSSON: Negative relationships between cellular immune response, Mhc class II heterozygosity and secondary sexual trait in the montane water vole, Evolutionary Applications 3 (2010) 279-290.

E. JÁNOVÁ, J. NESVADBOVÁ, M. HEROLDOVÁ, J. BRYJA: Effectiveness of two trapping protocols for studying the demography of common voles, Hystrix 21 (2010) 189-193.

P. KAŇUCH, A. FORNŮSKOVÁ, T. BARTONIČKA, J. BRYJA, Z. ŘEHÁK: Do two cryptic pipistrelle bat species differ in their autumn and winter roosting strategies within the range of sympatry?, Folia zoologica 59 (2010) 102-107.

A. KONEČNÝ, P. KOUBEK, J. BRYJA: Indications of higher diversity and abundance of small rodents in human-influenced Sudanian savannah than in the Niokolo Koba National Park (Senegal), African Journal of Ecology 48 (2010) 718-726.

H. PATZENHAUEROVÁ, J. BRYJA, R. ŠUMBERA: Kinship structure and mating system in a solitary subterranean rodent, the silvery mole-rat, Behavioral Ecology and Sociobiology 64 (2010) 757-767.

2009

T. ALBRECHT, M. VINKLER, J. SCHNITZER, R. POLÁKOVÁ, P. MUNCLINGER, J. BRYJA: Extra-pair fertilizations contribute to selection on secondary male ornamentation in a socially monogamous passerine, Journal of Evolutionary Biology 22 (2009) 2020-2030.

J. BRYJA, P. KAŇUCH, A. FORNŮSKOVÁ, T. BARTONIČKA, Z. ŘEHÁK: Low population genetic structuring of two cryptic bat species suggests their migratory behaviour in continental Europe, Biological Journal of the Linnean Society 96 (2009) 103-114.

L. E. CLIFT, P. ANDRLÍKOVÁ, M. FROLÍKOVÁ, P. STOPKA, J. BRYJA, B. F. FLANAGAN, P. M. JOHNSON, K. DVOŘÁKOVÁ-HORTOVÁ: Absence of spermatozoal CD46 protein expression and associated rapid acrosome reaction rate in striped field mice (Apodemus agrarius), Reproductive Biology and Endocrinology 7 (2009) 1-9.

B. KRYŠTUFEK, J. BRYJA, E. V. BUŽAN: Mitochondrial phylogeography of the European ground squirrel, Spermophilus citellus, yields evidence on refugia for steppic taxa in the southern Balkans, Heredity 103 (2009) 129-135.

M. PROMEROVÁ, T. ALBRECHT, J. BRYJA: Extremely high MHC class I variation in a population of a long-distance migrant, the Scarlet Rosefinch (Carpodacus erythrinus), Immunogenetics 61 (2009) 451-461.

M. REICHARD, M. ONDRAČKOVÁ, A. BRYJOVÁ, C. SMITH, J. BRYJA: Breeding resource distribution affects selection gradients on male phenotypic traits: experimental study on lifetime reproductive success in the bitterling fish (Rhodeus amarus), Evolution 63 (2009) 377-390.

M. VINKLER, A. BRYJOVÁ, T. ALBRECHT, J. BRYJA: Identification of the first toll-like receptor gene in passerine birds: TLR4 orthologue in zebra finch (Taeniopygia guttata), Tissue Antigens 74 (2009) 32-41.

2008

J. BRYJA, H. PATZENHAUEROVÁ, T. ALBRECHT, L. MOŠANSKÝ, M. STANKO, P. STOPKA: Varying levels of female promiscuity in four Apodemus mice species, Behavioral Ecology and Sociobiology 63 (2008) 251-260.

J. DETER, J. BRYJA, Y. CHAVAL, M. GALAN, H. HENTTONEN, J. LAAKKONEN, L. VOUTILAINEN, O. VAPALAHTI, A. VAHERI, A. R. SALVADOR, S. MORAND, J.-F. COSSON, N. CHARBONNEL: Association between the DQA MHC class II gene and Puumala virus infection in Myodes glareolus, the bank vole, Infection, Genetics and Evolution (2008) 450-458.

M. HEROLDOVÁ, E. TKADLEC, J. BRYJA, J. ZEJDA: Wheat or barley? Feeding preferences affect distribution of three rodent species in agricultural landscape, Applied Animal Behaviour Science 110 (2008) 354-362.

E. JÁNOVÁ, M. HEROLDOVÁ, J. BRYJA: Conspicuous demographic and individual changes in a population of the common vole in a set-aside alfalfa field, Annales Zoologici Fennici 45 (2008) 39-54.

V. NICOLAS, J. BRYJA, B. AKPATOU, A. KONEČNÝ, E. LECOMPTE, M. COLYN, A. LALIS, A. COULOUX, C. DENYS, L. GRANJON: Comparative phylogeography of two sibling species of forest-dwelling rodent (Praomys rostratus and P. tullbergi) in West Africa: different reactions to past forest fragmentation, Molecular Ecology 17 (2008) 5118-5134.

M. REICHARD, C. SMITH, J. BRYJA: Seasonal change in the opportunity for sexual selection, Molecular Ecology 17 (2008) 642-651.

Z. ŘEHÁK, T. BARTONIČKA, J. BRYJA, J. GAISLER: New records of the Alcathoe bat, Myotis alcathoe in Moravia (Czech Republic), Folia zoologica 57 (2008) 465-469.

C. TOLLENAERE, J. BRYJA, M. GALAN, P. CADET, J. DETER, Y. CHAVAL, K. BERTHIER, A. RIBAS SALVADOR, L. VOUTILAINEN, J. LAAKKONEN, H. HENTTONEN, J.-F. COSSON, N. CHARBONNEL: Multiple parasites mediate balancing selection at two MHC class II genes in the fossorial water vole: insights from multivariate analyses and population genetics, Journal of Evolutionary Biology 21 (2008) 1307-1320.

A. TÓTHOVÁ, J. KNOZ, R. SONNEK, J. BRYJA, J. VAŇHARA: Taxonomic problems in the subgenus Meloehelea Wirth of the genus Atrichopogon Kieffer (Diptera: Ceratopogonidae) inferred from both morphological and molecular characters, Entomologica Fennica 19 (2008) 1-12.

2007

T. ALBRECHT, J. SCHNITZER, J. KREISINGER, A. EXNEROVÁ, J. BRYJA, P. MUNCLINGER: Extrapair paternity and the opportunity for sexual selection in long-distant migratory passerines, Behavioral Ecology 18 (2007) 477-486.

J. BRYJA, P. KMENT: True bugs (Heteroptera) of the Bukovské vrchy Hills (Poloniny National Park, Slovakia), Acta Musei Moraviae. Scientiae biologicae = Časopis Moravského muzea. Vědy biologické - Scientiae biologicae 92 (2007) 1-51.

J. BRYJA, N. CHARBONNEL, K. BERTHIER, M. GALAN, J.-F. COSSON: Density-related changes in selection pattern for major histocompatibility complex genes in fluctuating populations of voles, Molecular Ecology 16 (2007) 5084-5097.

P. HÁJKOVÁ, C. PERTOLDI, B. ZEMANOVÁ, K. ROCHE, B. HÁJEK, J. BRYJA, J. ZIMA: Genetic structure and evidence for recent population decline in Eurasian otter populations in the Czech and Slovak Republics: implications for conservation, Journal of Zoology 272 (2007) 1-9.

M. HEROLDOVÁ, J. BRYJA, J. ZEJDA, E. TKADLEC: Structure and diversity of small mammal communities in agriculture landscape, Agriculture, Ecosystems and Environment (2007) 206-210.

P. KAŇUCH, A. FORNŮSKOVÁ, T. BARTONIČKA, J. BRYJA: Multiplex panels of polymorphic microsatellite loci for two cryptic bat species of the genus cross-species amplification within the family Vespertilionidae, Molecular Ecology Notes 7 (2007) 871-873.

P. KAŇUCH, P. HÁJKOVÁ, Z. ŘEHÁK, J. BRYJA: A rapid PCR-based test for species identification of two cryptic bats Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus and its application on museum and dropping samples, Acta Chiropterologica 9 (2007) 277-282.

P. KMENT, J. BRYJA: Description of Nasocoris lautereri sp. nov. from the Balkan peninsula, with a review of the genus Nasocoris (Hemiptera: Heteroptera: Miridae: Phylinae), Zootaxa 1633 (2007) 39-61.

A. LOISEAU, A. KONEČNÝ, M. GALAN, J. BRYJA, J.-F. COSSON, C. BROUAT: New polymorphic microsatellite loci for rodents of the genus Mastomys using PCR multiplexing, and cross-species amplification in Myomys and Praomys, Molecular Ecology Notes 7 (2007) 684-687.

R. POLÁKOVÁ, M. VYSKOČILOVÁ, J.-F. MARTIN, H. L. MAYS JR., G. E. HILL, J. BRYJA, T. ALBRECHT: A multiplex set of microsatellite markers for the scarlet rosefinch (Carpodacus erythrinus), Molecular Ecology Notes 7 (2007) 1375-1378.

2006

V. BENCOVÁ, T. KAŠPAR, J. BRYJA: Sezónní a meziroční změny skladby potravy kalouse ušatého (Asio otus) na jižní Moravě, Tichodroma 18 (2006) 65-71.

J. BRYJA, P. KMENT: Ploštice (Heteroptera) Chráněné krajinné oblasti Kokořínsko, Bohemia centralis 27 (2006) 267-294.

J. BRYJA, M. GALAN, N. CHARBONNEL, J.-F. COSSON: Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae), Immunogenetics 58 (2006) 191-202.

P. HÁJKOVÁ, B. ZEMANOVÁ, J. BRYJA, B. HÁJEK, K. ROCHE, E. TKADLEC, J. ZIMA: Factors affecting success of PCR amplification of microsatellite loci from otter faeces, Molecular Ecology Notes 6 (2006) 559-562.

P. KMENT, J. BRYJA: Revised occurrence of Heterotoma species (Heteroptera: Miridae) in the Czech Republic and Slovakia with remarks on nomenclature, diagnostic characters and ecology, Acta Musei Moraviae. Scientiae biologicae = Časopis Moravského muzea. Vědy biologické - Scientiae biologicae 91 (2006) 7-52.

A. TÓTHOVÁ, J. BRYJA, P. BEJDÁK, J. VAŇHARA: Molecular markers used in phylogenetic studies of Diptera with a methodological overview, Acta Universitatis Carolinae, Biologica (2006) 125-133.

2005

J. BRYJA, P. STOPKA: Facultative promiscuity in a presumably monogamous mouse Apodemus microps, Acta Theriologica 50 (2005) 189-196.

J. BRYJA, J. NESVADBOVÁ, M. HEROLDOVÁ, E. JÁNOVÁ, J. LOSÍK, L. TREBATICKÁ, E. TKADLEC: Common vole (Microtus arvalis) population sex ratio: biases and process variation, Canadian Journal of Zoology - Revue Canadienne de Zoologie 83 (2005) 1391-1399.

J. BRYJA, M. GALAN, N. CHARBONNEL, J.-F. COSSON: Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism, Molecular Ecology Notes 5 (2005) 173-176.

M. HEROLDOVÁ, E. JÁNOVÁ, J. BRYJA, E. TKADLEC: Set-aside plots - source of small mammal pests?, Folia zoologica 54 (2005) 337-350.

P. KMENT, J. BRYJA, K. HRADIL, Z. JINDRA: New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia 3, Klapalekiana 41 (2005) 157-213.

P. KMENT, J. BRYJA, Z. JINDRA: New records of true bugs (Heteroptera) of the Balkan peninsula, Acta entomologica slovenica 13 (2005) 9-20.

M. REICHARD, J. BRYJA, M. ONDRAČKOVÁ, M. DÁVIDOVÁ, P. KANIEWSKA, C. SMITH: Sexual selection for male dominance reduces opportunities for female mate choice in the European bitterling (Rhodeus sericeus), Molecular Ecology 14 (2005) 1533-1542.

2004

J. BRYJA, P. KMENT: Ploštice (Heteroptera) Bukovských vrchů (NP Poloniny), Folia faunistica Slovaca 9 (2004) 31-41.

P. HÁJKOVÁ, B. HÁJEK, B. ZEMANOVÁ, K. ROCHE, A. TOMAN, J. BRYJA: Genetická variabilita a populačno-genetická štruktúra subpopulácií vydry riečnej (Lutra lutra) v výskumnom projekte Českej a Slovenskej republike, Bulletin Vydra (2004) 19-23.

P. HÁJKOVÁ, B. ZEMANOVÁ, B. HÁJEK, K. ROCHE, M. KUČEROVÁ, J. BRYJA, J. ZIMA: Stanovenie početnosti a štruktúry populácie vydry riečnej (Lutra lutra) neinvazívnou genetickou metódou - správa o prebiehajúcom výskumnom projekte, Bulletin Vydra (2004) 15-18.

M. HEROLDOVÁ, J. ZEJDA, M. ZAPLETAL, D. OBDRŽÁLKOVÁ, E. JÁNOVÁ, J. BRYJA, E. TKADLEC: Importance of winter rape for small rodents, Rostlinná výroba 50 (2004) 175-181.

2003

J. BRYJA, A. KONEČNÝ: Fast sex identification in wild mammals using PCR amplification of the Sry gene, Folia zoologica 52 (2003) 269-274.

E. JÁNOVÁ, M. HEROLDOVÁ, J. NESVADBOVÁ, J. BRYJA, E. TKADLEC: Age variation in a fluctuating population of the common vole, Oecologia 137 (2003) 527-532.

E. JÁNOVÁ, M. HEROLDOVÁ, J. BRYJA, E. TKADLEC: Metodické problémy při určování stáří hlodavců na základě hmotnosti očních čoček, Lynx 34 (2003) 29-38.

P. KMENT, J. BRYJA, Z. JINDRA, K. HRADIL, P. BAŇAŘ: New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia 2, Klapalekiana 39 (2003) 257-306.

2002

T. BARTONIČKA, Z. ŘEHÁK, P. WOLF, J. BRYJA: Drobní savci CHKO Litovelské Pomoraví. Část 1. Netopýři - Chiroptera, Lynx 33 (2002) 35-46.

J. BRYJA, P. KMENT, K. HRADIL: Ploštice (Heteroptera) Rokytenských slepenců, Přírodovědný sborník Západomoravského muzea v Třebíči=Acta Scientiarum Naturalium Musei Moraviae Occidentalis 40 (2002) 33-60.

J. BRYJA, Z. ŘEHÁK, Z. VERMOUZEK, P. WOLF, T. BARTONIČKA: Drobní savci CHKO Litovelské Pomoraví. Část 2. Hmyzožravci a hlodavci - Insectivora et Rodentia, Lynx 33 (2002) 79-87.

J. BRYJA, Z. ŘEHÁK: Další doklady současné expanze areálu myšice temnopásé (Apodemus agrarius) na Moravě, Lynx 33 (2002) 69-77.

J. BRYJA, P. KMENT: New and interesting records of plant bugs (Heteroptera: Miridae) from the Czech and Slovak Republics, Klapalekiana 38 (2002) 1-10.

J. BRYJA, M. HEROLDOVÁ, J. ZEJDA: Effects of deforestation on structure and diversity of small mammal communities in the Moravskoslezské Beskydy Mts (Czech Republic), Acta Theriologica 47 (2002) 295-306.

A. KONEČNÝ, J. BRYJA: Hmyzožravci a hlodavci v ČR - souhrn nepublikovaných faunistických dat z diplomových prací obhájených na Přírodovědecké fakultě MU v Brně, Lynx 33 (2002) 133-140.

E. KULA, J. BRYJA: Comparison of various sampling methods for evaluation of biodiversity of true bugs (Heteroptera) in a birch forest, Ekológia 21 (2002) 137-147.

2001

J. BRYJA, P. KMENT: The present state of knowledge of true bugs (Heteroptera) in the Protected Landscape Area of Poodří (Czech Republic), Klapalekiana 37 (2001) 1-36.

J. BRYJA, B. BENEŠ: The harvest mouse (Micromys minutus) in the mountains of the Czech Republic, Časopis Slezského zemského muzea. - Série A: Vědy přírodní 50 (2001) 113-116.

J. BRYJA, M. HEROLDOVÁ, J. ZEJDA: Drobní zemní savci (Insectivora, Rodentia) vrcholových partií Moravskoslezských Beskyd, Časopis Slezského zemského muzea. - Série A: Vědy přírodní 50 (2001) 105-112.

J. BRYJA, E. TKADLEC, J. NESVADBOVÁ, J. GAISLER, J. ZEJDA: Comparison of enumeration and Jolly-Seber estimation of population size in the common vole Microtus arvalis, Acta Theriologica 46 (2001) 279-285.

P. KMENT, J. BRYJA: New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia, Klapalekiana 37 (2001) 231-248.

Z. LOSOSOVÁ, J. DANIHELKA, M. CHYTRÝ, M. HLUCHÝ, P. VÍTEK, J. MAREK, M. ŠKORPÍK, J. BEZDĚK, P. PRŮDEK, J. POISEL, P. LAUTERER, M. BAGAR, P. KMENT, J. BRYJA, P. JANŠTA: Předběžné výsledky monitoringu biodiverzity vinic a přilehlých lesostepních lokalit CHKO Pálava a NP Podyjí, Thayensia 4 (2001) 205-208.