RNDr., Mgr. Petr Soudek, Ph.D.

Leader of the Czech and International Projects:

  1. Study of accumulation of toxic metals by plants from genus Allium and determination of possible mechanisms of uptake. Grant Agency CR, No. 522/06/P002, (2006-2008) P. Soudek
  2. Study of plant response to heavy metal stress and production of stress protective compounds. MŠMT, COST 0605 (COST.FA0605OC9039) (2009-2011) P. Soudek
  3. Immobilization of heavy metals and metalloids in contaminated sites. MŠMT,  Kontakt ČR-ČLR, No. LH12162, (2012-2013) P. Soudek

Témata pro bakalářskou, diplomovou nebo disertační práci:

Po telefonické či e-mailové domluvě je možno níže uvedená téma přizpůsobit potřebám školy a studenta.

!!!!!!! Pro školní rok 2012/2013 hledáme studenty!!!!!!!


Polyaminy a jejich úloha při abiotickém stresu rostlin

Školitel: RNDr. Petr Soudek, Ph.D.

Konzultant: Prof. RNDr. Eva Tesařová, CSc., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK

kontakt: soudek@ueb.cas.cz, tel: 233 022 224

Diamin putrescin (Put), triamin spermidin (Spd) a tetramin spermin (Spm) jsou hlavní polyaminy (PAs) nalezené ve všech živých buňkách. Jsou to alifatické dusíkaté sloučeniny, pozitivně nabité při fyziologickém pH. Jejich vlastnostiumožňují PAs interagovat s negativne nabitými makromolekulami jako jsou DNA a RNA, proteiny a fosfolipidy a díky tomu se účastní regulace fyzikálních a chemických vlastností membrán, struktury nukleových kyselin a funkce a modulace enzymových aktivit. Polyaminy jsou účastny v širokém spektru regulačních procesů jako jsou podpora růstu, dělení buněk, replikace DNA a diferenciace buněk. V posledních letech vzrůstá zájem o studium účasti PAs při obranných reakcích rostlin proti různým environmentálním stresům. Je obecně známo, že všechny typy abiotického stresu indukují oxidativní stres. V posledních letech byly PAs testovány jako antioxidanty v některých environmentálních nepříznivých podmínkách, ale jejich jasná role jako antioxidantů je stále předmětem debat.

Cílem práce (rešerše) je vyhledat a přehledně shrnout publikované údaje o:

  1. polyaminech
  2. jejich úloze při různých typech abiotickém stresu

Studium a využití metabolismu rostlin pro degradaci organických xenobiotik

Školitel: RNDr. Petr Soudek, Ph.D.

Konzultant: Prof. RNDr. Eva Tesařová, CSc., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK

kontakt: soudek@ueb.cas.cz, tel: 233 022 224

Rostliny produkují mnoho komplexních a občas bizardních sekundárních metabolitů, které mohou podporovat specifické mikrobiální populace. Z předchozích remediací vody a půdy je známo, že mikrobiální populace se nezřídka výrazně podílí na přeměně nutrietů, metabolické degradaci nebo příjmu a sekvestraci kontaminantů. Rostliny poskytují mikroorganismům důležitou podporu a je to obvykle asociace rostlin s mikroorganismy, která je základem efektivních fytotechnologií. Chceme vyhledat vhodné páry ze sloučenin obsažených v jedovatých rostlinách a strukturních homologů problematických polutantů. Předpokládáme, že jedinečná mikrobiální společenstva žijící v přítomnosti jedovatých rostlin budou mít mechanismus (nebo enzymatický aparát) pro degradaci s mnohem vyšší účinností a rychlostí, využitelný pro remediaci párových polutantů. Jedním z příkladů párování, který bude v projektu využit, je jedovatý sekundární metabolit kumarin z komonice lékařské (Melilotus officinalis) a polutant naftalén. Výsledkem použití komonice pro odstranění sloučenin naftalénu z kontaminované půdy bylo zvýšení rychlosti odstranění polutantu. Použití samotného kumarinu (bez rostlin) stimulovalo odstranění polutantu jen velmi nepatrně. Z toho plyne, že asociace mikroorganismů s rostlinami je klíčovou pro zvýšení rychlosti degradace homologních polutantů. Druhým příkladem je reveň dlanitá (Rheum palmatum), která produkuje ve svých oddéncích řadu antrachinonových derivátů jako např. rhein, rheum-emodin, chrysofanol aj. Bylo ověřeno, že má schopnost degradovat antrachinon sulfonové kyseliny, které jsou odpadními meziprodukty při výrobě barviv. Využití poznatků chemické ekologie k identifikaci rostlinných druhů vhodných pro efektivnější aplikace fytotechnologií by mělo poskytnout nové možnosti při řešení problémů s kontaminací vody a půdy, kterým čelíme po celém světě.

 


Thorium - jeho vliv na růst a vývoj rostlin

Školitel: RNDr. Petr Soudek, Ph.D.

Konzultant: Prof. RNDr. Eva Tesařová, CSc., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK

kontakt: soudek@ueb.cas.cz, tel: 233 022 224

Thorium nachází v současnosti hlavní využití v jaderné energetice jako potenciální zdroj štěpného materiálu. Samotný nuklid 232Th je α-zářič a nemůže se proto zapojit do spontánní štěpné reakce. Při záchytu neutronů se však může přeměnit na 233U, který je výborným jaderným palivem a silným zdrojem neutronů. Thorium se vyskytuje v přírodě přibližně třikrát častěji než uran, proto je pochopitelně značně lákavé využít jej v energetice.

 


Remediace „nových“ xenobiotik z komunálních odpadních vod

Školitel: RNDr. Petr Soudek, Ph.D.

Konzultant: Prof. RNDr. Eva Tesařová, CSc., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK

kontakt: soudek@ueb.cas.cz, tel: 233 022 224

Pojmem „nové“ xenobiotikum označuje antropogenní kontaminanty, které jsou uvolňovány do životního prostředí řádově desítky let, nicméně o jejich osud a působení na přírodu se lidé začali zajímat relativně nedávno. Do této skupiny patří již řadu let například PCB, perzistentní organické polutanty (POP) a celá řada dalších organických pesticidů. V poslední době k nim přibyly i polybromované retardátory hoření (BFR), přípravky pro osobní hygienu, detergenty a farmaka.


Fyziologické změny v rostlinách v přítomnosti uranylových iontů

Školitel: RNDr. Petr Soudek, Ph.D.

Konzultant: Prof. RNDr. Eva Tesařová, CSc., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK

kontakt: soudek@ueb.cas.cz, tel: 233 022 224

Lidská činnost je významným zdrojem radionuklidů v životním prostředí (těžba a zpracování uranových rud, provoz jaderných elektráren, spalování uhlí, fosfátová hnojiva, testování nukleárních zbraní a v neposlední řadě jaderné havárie). Pro svoji toxicitu představují radionuklidy v životním prostředí velké riziko a to i kvůli jejich možnému šíření potravním řetězcem. Proto hledáme způsoby, jak tuto kontaminaci co nejšetrněji z prostředí odstranit. Jedním ze šetrných způsobů je použití fytoremediačních metod. Ty využívají různých mechanismů rostlin, jež mění chemické složení zeminy, na které rostou. Rostliny přijímají z okolního prostředí živiny a další látky, včetně radionuklidů, a ty pak mohou hromadit ve svých orgánech. V podstatě lze pak rostliny použít k čištění kontaminovaných půd, povrchových i podzemních vod a sedimentů.
Práce se bude zabývat studiem akumulace uranu hydroponicky pěstovanými rostlinami. Bude sledováno množství akumulovaného uranu, jeho translokace v rostlinách a vliv uranu na fyziologické a biochemické pochody v rostlinách.