Jsme součástí Filosofického ústavu Akademie věd ČR v Praze, kam bylo komeniologické pracoviště převedeno v roce 1990 z Pedagogického ústavu J. A. Komenského ČSAV (bližší informace k dějinám a významu oddělení viz historie).

Hlavní činností našeho oddělení je péče o vydávání kompletního díla Jana Amose Komenského v jazycích originálu, vedle níž hledáme odpovědi na badatelské otázky z různých oblastí interpretace díla J. A. Komenského a jeho vztahů k ideovým předchůdcům, současným myslitelům nebo politickým a kulturním činitelům a v neposlední řadě i působení myslitelského odkazu Komenského v následujících epochách až po současnost. Tato problematika je organickou součástí dějin kultury v širokém smyslu slova, proto zařazujeme do svého programu i témata, která tradiční vlastní komeniologická studia přesahují. Kromě toho je ale většina členů oddělení činna i pedagogicky na několika univerzitách, řada z nich je rovněž na různých úrovních zapojena do organizace vědecké práce (podrobněji viz lidé).

Významnou součástí činnosti oddělení je také redakce mezinárodní revue Acta Comeniana.

V obou větvích činnosti – ediční i interpretační – využíváme možností získávat projekty a granty jak od domácích, tak zahraničních poskytovatelů podpory vědě a výzkumu i badatelského zájmu jednotlivých pracovníků pro volbu témat (další informace viz bádání o Komenském, konference).