Mgr. Libor Mořkovský

Pozice: odborný pracovník
Zaměření: bioinformatika
Oddělení: Detašované pracoviště Studenec
Telefon:
Mobil: +420 728 817 636
E-mail: morkovsknatur.cuni.cz

Výzkumné směry

evoluční genomika,

bioinformatika,

evoluce pohlavních chromosomů.

Vzdělání

1997–2005: Gymnázium České Budějovice.

2005–2008: bakalářské studium - Univerzita Karlova Praha, přírodovědecká fakulta, molekulární biologie a biochemie. Práce: Evoluce genového obsahu pohlavních chromosomů.

2008–2010: magisterské studium - Univerzita Karlova Praha, přírodovědecká fakulta, vývojová biologie. Diplomová práce: Charakterizace genového obsahu chromosomu Z u kura domácího.

2010-současnost: doktorské studium - Univerzita Karlova Praha, přírodovědecká fakulta, zoologie. Disertační práce: Genomika speciace u vybraných druhů ptáků, savců a ryb.

Zaměstnání

2010-současnost: Univerzita Karlova Praha, přírodovědecká fakulta, Laboratoř pro výzkum biodiverzity,

2012-současnost: Ústav biologie obratlovců, oddělení populační biologie Studenec.

Zkušenosti a praxe

programování v jazycích: C/C++, Python, R, Perl, Matlab, bash, Java, PHP, Action Scipt,

bioinformatika: BioConductor, Ensembl API, BioPerl, NumPy,

statistika: využívání lineárních modelů a ordinačních metod (PCA, CCA, mds) pro analýzu expresních čipů fy Affymetrix, základní znalosti strojového učení (machine learning),

zkušenosti s gridovými výpočty: MetaCentrum – český národní grid: distribuované úlohy pro systémy PBS a Torque, Leibniz-Rechenzentrum v Mnichově: využívání vizualizačních superpočítačů (rozvrhováno systémem SGE), ESRF v Grenoble: paralelní zpracování dat v systému CONDOR,

administrace linuxového serveru.

Projekt

Technologie nové generace v evoluční genetice